Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3AO14802 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3AO14802 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms