Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YIPF1Q9Y548 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF1Q9Y548 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms