Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms