Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST12Q9NRB3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST12Q9NRB3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms