Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C10orf88Q9H8K7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C10orf88Q9H8K7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms