Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms