Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf88Q9BSF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms