Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms