Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX2Q96KN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms