Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms