Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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