Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRAIDQ6UW56 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms