Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM74A1Q5RGS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms