Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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SNCBQ16143 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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