Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-37■■■■■ 36.4
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SF3A3Q12874 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 TRIM66-203ENST00000481014 6505 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 TNFRSF10B-204ENST00000519028 612 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 TNFRSF10B-205ENST00000519910 546 ntTSL 412.38□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 36.4
SF3A3Q12874 FARP1-203ENST00000423063 764 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-219ENST00000472478 745 ntTSL 38.85□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 28.05□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.98□□□□□ -1.298e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 56.97□□□□□ -1.298e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 56.96□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 26.6□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.368e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.88e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.285e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-209ENST00000531037 1560 ntTSL 314.56□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-205ENST00000447929 1983 ntTSL 325.71■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 524.5■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-213ENST00000479038 452 ntTSL 314.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 GUSB-210ENST00000475316 505 ntTSL 37.78□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 FLNA-210ENST00000462590 1026 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-27■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 PPAN-204ENST00000444703 757 ntTSL 323.57■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 PPAN-208ENST00000486482 1017 ntTSL 222.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 36.3
SF3A3Q12874 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 36.3
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SF3A3Q12874 FZR1-206ENST00000588327 675 ntTSL 321.08■□□□□ 0.979e-8■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 219.41■□□□□ 0.71e-14■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.651e-14■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 317.54■□□□□ 0.41e-14■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-14■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-14■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 317.11■□□□□ 0.331e-14■■■■■ 36.2
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SF3A3Q12874 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 411.48□□□□□ -0.571e-14■■■■■ 36.2
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SF3A3Q12874 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 219.78■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 UAP1L1-203ENST00000474787 4412 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 36.2
SF3A3Q12874 HAAO-205ENST00000406007 760 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 36.1
SF3A3Q12874 DVL2-202ENST00000571745 560 ntTSL 414.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 36.1
SF3A3Q12874 DVL2-211ENST00000576285 701 ntTSL 28.89□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 36.1
SF3A3Q12874 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 411.92□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 36.1
SF3A3Q12874 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 36
SF3A3Q12874 AP1G2-231ENST00000557189 678 ntTSL 214.17□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 36
SF3A3Q12874 AP1G2-208ENST00000553756 656 ntTSL 312.53□□□□□ -0.48e-9■■■■■ 36
SF3A3Q12874 AP1G2-233ENST00000557482 728 ntTSL 510.58□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 36
SF3A3Q12874 AP1G2-210ENST00000554312 635 ntTSL 28.19□□□□□ -1.18e-9■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.529e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.39e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-207ENST00000518692 726 ntTSL 515.06■□□□□ 09e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 213.22□□□□□ -0.299e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-210ENST00000519362 1807 ntTSL 212.76□□□□□ -0.379e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-209ENST00000519141 1699 ntTSL 212.26□□□□□ -0.459e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 212.15□□□□□ -0.469e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-219ENST00000522321 760 ntTSL 411.8□□□□□ -0.529e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-203ENST00000517693 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.539e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.569e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.599e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 28.58□□□□□ -1.049e-19■■■■■ 36
SF3A3Q12874 METTL22-215ENST00000567295 714 ntTSL 313.03□□□□□ -0.329e-16■■■■■ 36
SF3A3Q12874 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 36
SF3A3Q12874 KIFC3-209ENST00000562311 777 ntTSL 521.83■■□□□ 1.093e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-223ENST00000565684 623 ntTSL 519.78■□□□□ 0.763e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.678e-9■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 FLCN-205ENST00000417064 757 ntTSL 217.25■□□□□ 0.358e-9■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-210ENST00000562503 737 ntTSL 414.94□□□□□ -0.023e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-228ENST00000566975 580 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-208ENST00000561524 577 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-226ENST00000566648 651 ntTSL 313.55□□□□□ -0.243e-16■■■■■ 35.9
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