Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGHMBP2P38935 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms