Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms