Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHOX2AO14813 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2AO14813 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms