Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 AAGAB-202ENST00000538028 1777 ntTSL 28.41□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.077e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 WDR36-201ENST00000504122 554 ntTSL 47.84□□□□□ -1.157e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.167e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 PHTF2-209ENST00000454592 1563 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NMD3-207ENST00000473909 600 ntTSL 27.76□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NMD3-210ENST00000493066 746 ntTSL 37.76□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 RAPGEF2-210ENST00000511336 582 ntTSL 37.73□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 37.61□□□□□ -1.197e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 GLB1-208ENST00000446732 631 ntTSL 37.56□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-216ENST00000494558 710 ntTSL 57.55□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 57.23□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 AC005381.1-202ENST00000592716 574 ntTSL 57.16□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 SMAD4-212ENST00000591126 4970 ntTSL 1 (best)6.74□□□□□ -1.337e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 26.69□□□□□ -1.347e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.347e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.357e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TRIM37-213ENST00000585287 634 ntTSL 56.59□□□□□ -1.357e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MDN1-204ENST00000487831 689 ntTSL 26.57□□□□□ -1.367e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 XYLB-205ENST00000487569 365 ntTSL 56.56□□□□□ -1.367e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.377e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 RBM34-210ENST00000495224 549 ntTSL 26.42□□□□□ -1.387e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ZCCHC11-206ENST00000469810 3757 ntTSL 26.42□□□□□ -1.387e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NCAPG2-211ENST00000621338 597 ntTSL 36.38□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 LCP1-205ENST00000460190 765 ntTSL 26.35□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NMD3-203ENST00000460503 547 ntTSL 46.3□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.417e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.427e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 DLEU1-205ENST00000463357 274 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-215ENST00000514141 4345 ntTSL 1 (best)6.11□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.447e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MOSPD2-205ENST00000495110 1838 ntTSL 26.01□□□□□ -1.457e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-214ENST00000511527 1594 ntTSL 26.01□□□□□ -1.457e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TRIM37-211ENST00000583945 430 ntTSL 35.9□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MTF2-206ENST00000473430 760 ntTSL 55.83□□□□□ -1.487e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ACADVL-213ENST00000578579 458 ntTSL 35.59□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 45.45□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 DROSHA-203ENST00000504133 617 ntTSL 35.39□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MDM4-201ENST00000367179 697 ntTSL 35.35□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.567e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 UBE3C-204ENST00000469336 655 ntTSL 25.25□□□□□ -1.577e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TTC37-205ENST00000505578 664 ntTSL 35.22□□□□□ -1.577e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 DROSHA-210ENST00000510178 379 ntTSL 55.18□□□□□ -1.587e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 PHTF2-212ENST00000479515 2467 ntTSL 55.01□□□□□ -1.617e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ZCCHC11-221ENST00000531722 1016 ntTSL 34.94□□□□□ -1.627e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 BCLAF1-211ENST00000529917 1336 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 CDC27-215ENST00000573550 583 ntTSL 34.73□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 XPO5-204ENST00000424378 624 ntTSL 34.66□□□□□ -1.667e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 BCLAF1-204ENST00000526228 572 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 BCLAF1-209ENST00000529522 1093 ntTSL 24.19□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 BCLAF1-221ENST00000534762 744 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-204ENST00000462221 817 ntTSL 54.06□□□□□ -1.767e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-212ENST00000482093 725 ntTSL 53.98□□□□□ -1.777e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TTC37-203ENST00000503279 583 ntTSL 23.87□□□□□ -1.797e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 NMD3-209ENST00000478160 606 ntTSL 33.8□□□□□ -1.87e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 PAPOLA-220ENST00000556459 959 ntTSL 53.74□□□□□ -1.817e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-210ENST00000474505 1010 ntTSL 23.72□□□□□ -1.817e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 CSNK2A2-202ENST00000562367 687 ntTSL 33.72□□□□□ -1.817e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.837e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.837e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 MARCH7-208ENST00000478396 797 ntTSL 53.57□□□□□ -1.847e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 ABHD3-210ENST00000584464 440 ntTSL 23.41□□□□□ -1.867e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-207ENST00000505975 2727 ntTSL 23.38□□□□□ -1.877e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.877e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-207ENST00000469331 553 ntTSL 23.27□□□□□ -1.897e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EXOC5-209ENST00000556629 693 ntTSL 33.27□□□□□ -1.897e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 POLK-212ENST00000509126 2441 ntTSL 23.18□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 CDC27-212ENST00000570818 656 ntTSL 53.16□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 33.08□□□□□ -1.927e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 22.71□□□□□ -1.987e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 XPO5-210ENST00000496341 800 ntTSL 52.69□□□□□ -1.987e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 CDC27-216ENST00000574304 514 ntTSL 52.65□□□□□ -1.997e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-215ENST00000490505 568 ntTSL 52.5□□□□□ -2.017e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 TTC37-204ENST00000504421 337 ntTSL 52.5□□□□□ -2.017e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 42.34□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 EIF2A-211ENST00000477551 1906 ntTSL 1 (best)2.26□□□□□ -2.057e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 31.29□□□□□ -2.27e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 PIF1-208ENST00000560444 1631 ntTSL 224.65■■□□□ 1.548e-16■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 SRRT-205ENST00000449389 448 ntTSL 311.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 33.4
SF3B1O75533 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 214.8□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 RCOR3-206ENST00000485186 434 ntTSL 33.44□□□□□ -1.867e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.484e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 518.48■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 218.32■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 517.24■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 212.66□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 33.3
SF3B1O75533 EIF3M-207ENST00000530026 769 ntTSL 24.52□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 33.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3692.4 ms