RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.69□□□□□ -0.54
POLK-215ENST00000514141 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa10.33□□□□□ -0.76
POLK-215ENST00000514141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.91□□□□□ -0.82
POLK-215ENST00000514141 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.9□□□□□ -0.82
POLK-215ENST00000514141 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.81□□□□□ -0.84
POLK-215ENST00000514141 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
POLK-215ENST00000514141 NACADO15069 1562 aa9.71□□□□□ -0.85
POLK-215ENST00000514141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.62□□□□□ -0.87
POLK-215ENST00000514141 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.48□□□□□ -0.89
POLK-215ENST00000514141 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLK-215ENST00000514141 ABCC9O60706 1549 aa9.41□□□□□ -0.9
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POLK-215ENST00000514141 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLK-215ENST00000514141 SCRIBQ14160 1630 aa9.22□□□□□ -0.93
POLK-215ENST00000514141 TRIM41Q8WV44 630 aa9.16□□□□□ -0.94
POLK-215ENST00000514141 APLP2Q06481 763 aa9.14□□□□□ -0.95
POLK-215ENST00000514141 EEA1Q15075 1411 aa9.14□□□□□ -0.95
POLK-215ENST00000514141 SMARCA2P51531 1590 aa9.13□□□□□ -0.95
POLK-215ENST00000514141 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
POLK-215ENST00000514141 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
POLK-215ENST00000514141 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.99□□□□□ -0.97
POLK-215ENST00000514141 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
POLK-215ENST00000514141 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
POLK-215ENST00000514141 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
POLK-215ENST00000514141 SMARCA4P51532 1647 aa8.92□□□□□ -0.98
POLK-215ENST00000514141 ABCC8Q09428 1581 aa8.89□□□□□ -0.99
POLK-215ENST00000514141 HMGXB3Q12766 1538 aa8.86□□□□□ -0.99
POLK-215ENST00000514141 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
POLK-215ENST00000514141 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POLK-215ENST00000514141 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.83□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 NCAPD3P42695 1498 aa8.82□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.79□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.79□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.78□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.77□□□□□ -1
POLK-215ENST00000514141 GOLGA3Q08378 1498 aa8.77□□□□□ -1.01
POLK-215ENST00000514141 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.76□□□□□ -1.01
POLK-215ENST00000514141 KIF27Q86VH2 1401 aa8.76□□□□□ -1.01
POLK-215ENST00000514141 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.73□□□□□ -1.01
POLK-215ENST00000514141 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.7□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.7□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.67□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 WIZO95785 1651 aa8.66□□□□□ -1.02
POLK-215ENST00000514141 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.64□□□□□ -1.03
POLK-215ENST00000514141 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.64□□□□□ -1.03
POLK-215ENST00000514141 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.59□□□□□ -1.03
POLK-215ENST00000514141 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.59□□□□□ -1.03
POLK-215ENST00000514141 CFTRP13569 1480 aa8.58□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.58□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 CLIP1P30622 1438 aa8.56□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 KIF21BO75037 1637 aa8.54□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.54□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 WDR97A6NE52 1622 aa8.53□□□□□ -1.04
POLK-215ENST00000514141 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.52□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 TOP2BQ02880 1626 aa8.51□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 FMN1Q68DA7 1419 aa8.5□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 ERCC6Q03468 1493 aa8.5□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CEP162Q5TB80 1403 aa8.5□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.5□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.49□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.48□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 HRCP23327 699 aa8.48□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 PRDM2Q13029 1718 aa8.48□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.47□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CUX2O14529 1486 aa8.47□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.47□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.47□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.46□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.46□□□□□ -1.05
POLK-215ENST00000514141 SOGA1O94964 1423 aa8.46□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.46□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 CUL7Q14999 1698 aa8.44□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 IFT140Q96RY7 1462 aa8.44□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.43□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.43□□□□□ -1.06
POLK-215ENST00000514141 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.4□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.39□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 MAP3K1Q13233 1512 aa8.38□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.38□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.38□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 GRIN2BQ13224 1484 aa8.37□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 CUX1P39880 1505 aa8.36□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.36□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 SLC24A1O60721 1099 aa8.35□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.35□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.34□□□□□ -1.07
POLK-215ENST00000514141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 26.9
POLK-215ENST00000514141 PRXQ9BXM0 1461 aa8.33□□□□□ -1.08
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