Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATPIF1Q9UII2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATPIF1Q9UII2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms