Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAE1Q9UBE0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms