Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BATF3Q9NR55 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BATF3Q9NR55 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms