Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM55Q9BYV6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms