Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAPERQ9BY12 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms