Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RSG1Q9BU20 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms