Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)28.74■■■□□ 2.191e-28■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.671e-28■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 TKFC-217ENST00000533393 597 ntTSL 525.73■■□□□ 1.711e-8■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 320.41■□□□□ 0.864e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 GPI-217ENST00000592277 615 ntTSL 419.38■□□□□ 0.694e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 FLII-211ENST00000488932 838 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ZNF791-206ENST00000600752 576 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 PSD4-212ENST00000493329 606 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ZNF791-205ENST00000598225 704 ntTSL 413.4□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 PIK3C3-210ENST00000589056 2074 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 510.94□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RALGDS-206ENST00000424572 926 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.914e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RNF19A-215ENST00000524233 571 ntTSL 38.05□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ZNF791-204ENST00000597691 576 ntTSL 26.62□□□□□ -1.354e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 PIK3C3-216ENST00000597477 618 ntTSL 25.25□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-211ENST00000623632 847 ntTSL 522.11■■□□□ 1.132e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.692e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-218ENST00000636265 1239 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-222ENST00000637669 1927 ntTSL 516.87■□□□□ 0.292e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-214ENST00000624474 678 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-209ENST00000623287 856 ntTSL 513.13□□□□□ -0.312e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-221ENST00000637666 1135 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-212ENST00000623978 712 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-9■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 415.35■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 25.8
BUD13Q9BRD0 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 219.02■□□□□ 0.647e-10■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 RNASET2-211ENST00000509073 433 ntTSL 28.69□□□□□ -1.027e-8■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 WDR90-206ENST00000546923 742 ntTSL 520.92■□□□□ 0.943e-7■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 515.24■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-8■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-213ENST00000453698 1322 ntTSL 520.12■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-215ENST00000483342 1509 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-208ENST00000437028 1169 ntTSL 318.13■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-202ENST00000400436 2652 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-210ENST00000442419 741 ntTSL 313.6□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 PGK1-202ENST00000474281 307 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.424e-26■■■■□ 25.7
BUD13Q9BRD0 GRHL1-208ENST00000497403 5400 ntTSL 211.89□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 GRHL1-203ENST00000439493 564 ntTSL 57.42□□□□□ -1.227e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 MYO18B-203ENST00000418374 6363 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 EPHB4-207ENST00000489808 921 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.082e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 EPHB4-204ENST00000477446 1551 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 SKP2-206ENST00000513151 901 ntTSL 310.07□□□□□ -0.87e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 SIPA1-202ENST00000526137 379 ntTSL 330.83■■■□□ 2.533e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 SIPA1-208ENST00000533361 562 ntTSL 425.19■■□□□ 1.623e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 STAT2-207ENST00000556539 3278 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-203ENST00000548478 2270 ntTSL 1 (best)23.52■■□□□ 1.363e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.093e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.043e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-207ENST00000550596 569 ntTSL 415.16■□□□□ 0.023e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-209ENST00000551835 561 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DTX3-205ENST00000549583 1331 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.273e-8■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.255e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 223.66■■□□□ 1.381e-10■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 DDX17-207ENST00000475004 443 ntTSL 311.29□□□□□ -0.66e-10■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 APOC1-208ENST00000592535 430 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 215.12■□□□□ 0.014e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 210.03□□□□□ -0.84e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 UBE3C-208ENST00000497368 776 ntTSL 26.49□□□□□ -1.374e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CROCCP3-206ENST00000591348 1695 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.031e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-209ENST00000483652 1994 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.991e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-208ENST00000482956 855 ntTSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.971e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-206ENST00000450207 963 ntTSL 520.81■□□□□ 0.921e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 ZNF395-209ENST00000522795 501 ntTSL 313.89□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 412.38□□□□□ -0.431e-9■■■■□ 25.6
BUD13Q9BRD0 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-9■■■■□ 25.6
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 1814 ms