RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526137.1

SIPA1-202, Transcript of signal-induced proliferation-associated 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1, Length 379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1-202ENST00000526137 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.2■■■■■ 8.03
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC9O60706 1549 aa58.88■■■■■ 7.02
SIPA1-202ENST00000526137 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.38■■■■■ 6.94
SIPA1-202ENST00000526137 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.81■■■■■ 6.52
SIPA1-202ENST00000526137 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.63■■■■■ 6.5
SIPA1-202ENST00000526137 NACADO15069 1562 aa55.4■■■■■ 6.46
SIPA1-202ENST00000526137 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.32■■■■■ 6.45
SIPA1-202ENST00000526137 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.92■■■■■ 6.38
SIPA1-202ENST00000526137 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.6■■■■■ 6.33
SIPA1-202ENST00000526137 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.33■■■■■ 6.29
SIPA1-202ENST00000526137 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.24■■■■■ 6.27
SIPA1-202ENST00000526137 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.95■■■■■ 6.23
SIPA1-202ENST00000526137 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.8■■■■■ 6.2
SIPA1-202ENST00000526137 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.45■■■■■ 6.15
SIPA1-202ENST00000526137 SCRIBQ14160 1630 aa53.29■■■■■ 6.12
SIPA1-202ENST00000526137 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
SIPA1-202ENST00000526137 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.06■■■■■ 6.09
SIPA1-202ENST00000526137 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.92■■■■■ 6.06
SIPA1-202ENST00000526137 NCAPD3P42695 1498 aa51.28■■■■■ 5.8
SIPA1-202ENST00000526137 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.23■■■■■ 5.79
SIPA1-202ENST00000526137 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.06■■■■■ 5.76
SIPA1-202ENST00000526137 ERCC6Q03468 1493 aa50.83■■■■■ 5.73
SIPA1-202ENST00000526137 SMARCA2P51531 1590 aa50.81■■■■■ 5.72
SIPA1-202ENST00000526137 SMARCA4P51532 1647 aa50.8■■■■■ 5.72
SIPA1-202ENST00000526137 CUX2O14529 1486 aa50.79■■■■■ 5.72
SIPA1-202ENST00000526137 HMGXB3Q12766 1538 aa50.73■■■■■ 5.71
SIPA1-202ENST00000526137 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.56■■■■■ 5.68
SIPA1-202ENST00000526137 NESP48681 1621 aa50.51■■■■■ 5.68
SIPA1-202ENST00000526137 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.5■■■■■ 5.67
SIPA1-202ENST00000526137 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.34■■■■■ 5.65
SIPA1-202ENST00000526137 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.25■■■■■ 5.63
SIPA1-202ENST00000526137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50■■■■■ 5.6
SIPA1-202ENST00000526137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.89■■■■■ 5.58
SIPA1-202ENST00000526137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.85■■■■■ 5.57
SIPA1-202ENST00000526137 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.73■■■■■ 5.55
SIPA1-202ENST00000526137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.62■■■■■ 5.53
SIPA1-202ENST00000526137 WIZO95785 1651 aa49.52■■■■■ 5.52
SIPA1-202ENST00000526137 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.38■■■■■ 5.5
SIPA1-202ENST00000526137 WDR62O43379 1518 aa49.23■■■■■ 5.47
SIPA1-202ENST00000526137 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.19■■■■■ 5.47
SIPA1-202ENST00000526137 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.13■■■■■ 5.46
SIPA1-202ENST00000526137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.1■■■■■ 5.45
SIPA1-202ENST00000526137 CFTRP13569 1480 aa49.07■■■■■ 5.45
SIPA1-202ENST00000526137 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.91■■■■■ 5.42
SIPA1-202ENST00000526137 TRIM41Q8WV44 630 aa48.85■■■■■ 5.41
SIPA1-202ENST00000526137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
SIPA1-202ENST00000526137 OSCARQ8IYS5 282 aa48.6■■■■■ 5.37
SIPA1-202ENST00000526137 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.48■■■■■ 5.35
SIPA1-202ENST00000526137 IFT140Q96RY7 1462 aa48.19■■■■■ 5.31
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
SIPA1-202ENST00000526137 PRDM2Q13029 1718 aa48.15■■■■■ 5.3
SIPA1-202ENST00000526137 TOPBP1Q92547 1522 aa48.12■■■■■ 5.29
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC8Q09428 1581 aa47.99■■■■■ 5.27
SIPA1-202ENST00000526137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.85■■■■■ 5.25
SIPA1-202ENST00000526137 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
SIPA1-202ENST00000526137 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
SIPA1-202ENST00000526137 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
SIPA1-202ENST00000526137 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.75■■■■■ 5.236e-6■□□□□ 11.2
SIPA1-202ENST00000526137 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGEF11O15085 1522 aa47.66■■■■■ 5.22
SIPA1-202ENST00000526137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
SIPA1-202ENST00000526137 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.63■■■■■ 5.22
SIPA1-202ENST00000526137 FBLN2P98095 1184 aa47.54■■■■■ 5.2
SIPA1-202ENST00000526137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.51■■■■■ 5.2
SIPA1-202ENST00000526137 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.5■■■■■ 5.19
SIPA1-202ENST00000526137 SOGA1O94964 1423 aa47.47■■■■■ 5.19
SIPA1-202ENST00000526137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
SIPA1-202ENST00000526137 CHD1O14646 1710 aa47.33■■■■■ 5.17
SIPA1-202ENST00000526137 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.28■■■■■ 5.16
SIPA1-202ENST00000526137 ARAP1Q96P48 1450 aa47.21■■■■■ 5.15
SIPA1-202ENST00000526137 CUX1P39880 1505 aa47.2■■■■■ 5.15
SIPA1-202ENST00000526137 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.17■■■■■ 5.14
SIPA1-202ENST00000526137 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
SIPA1-202ENST00000526137 WDR97A6NE52 1622 aa47.07■■■■■ 5.13
SIPA1-202ENST00000526137 GRIN2BQ13224 1484 aa47.04■■■■■ 5.12
SIPA1-202ENST00000526137 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
SIPA1-202ENST00000526137 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
SIPA1-202ENST00000526137 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.94■■■■■ 5.1
SIPA1-202ENST00000526137 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
SIPA1-202ENST00000526137 SYNJ2O15056 1496 aa46.89■■■■■ 5.1
SIPA1-202ENST00000526137 SYNJ1O43426 1573 aa46.86■■■■■ 5.09
SIPA1-202ENST00000526137 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.84■■■■■ 5.09
SIPA1-202ENST00000526137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.74■■■■■ 5.07
SIPA1-202ENST00000526137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.57■■■■■ 5.05
SIPA1-202ENST00000526137 PBRM1Q86U86 1689 aa46.57■■■■■ 5.05
SIPA1-202ENST00000526137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.04
SIPA1-202ENST00000526137 GRIN2AQ12879 1464 aa46.41■■■■■ 5.02
SIPA1-202ENST00000526137 TOP2BQ02880 1626 aa46.31■■■■■ 5
SIPA1-202ENST00000526137 NUP160Q12769 1436 aa46.3■■■■■ 5
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SIPA1-202ENST00000526137 ADAMTS12P58397 1594 aa46.25■■■■■ 4.99
SIPA1-202ENST00000526137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.24■■■■■ 4.99
SIPA1-202ENST00000526137 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.23■■■■■ 4.99
SIPA1-202ENST00000526137 CEP170Q5SW79 1584 aa46.2■■■■■ 4.99
SIPA1-202ENST00000526137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
SIPA1-202ENST00000526137 SHROOM2Q13796 1616 aa45.98■■■■■ 4.95
SIPA1-202ENST00000526137 JPH4Q96JJ6 628 aa45.95■■■■■ 4.95
SIPA1-202ENST00000526137 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
SIPA1-202ENST00000526137 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
SIPA1-202ENST00000526137 IGF1RP08069 1367 aa45.64■■■■■ 4.9
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