Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf60Q5U649 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf60Q5U649 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms