Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms