Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 518.59■□□□□ 0.575e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.297e-8■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 CBFB-205ENST00000564034 509 ntTSL 223.31■■□□□ 1.324e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.134e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.725e-10■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MRPS15-202ENST00000462067 1612 ntTSL 210.16□□□□□ -0.785e-10■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KNOP1-203ENST00000565844 1394 ntTSL 515.25■□□□□ 0.033e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.058e-9■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.027e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 321.1■□□□□ 0.979e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 HMGXB4-203ENST00000420166 1257 ntTSL 220.47■□□□□ 0.879e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.789e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.769e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.549e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-207ENST00000429877 870 ntTSL 317.46■□□□□ 0.399e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.349e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.259e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.239e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.239e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.179e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-206ENST00000428012 766 ntTSL 315.82■□□□□ 0.129e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.129e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.119e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-210ENST00000482140 667 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.019e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -09e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PIP4K2B-201ENST00000613767 478 ntTSL 414.96□□□□□ -0.019e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.039e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 514.83□□□□□ -0.049e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-207ENST00000538117 580 ntTSL 414.83□□□□□ -0.049e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.049e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.169e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.179e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 HMGXB4-204ENST00000455359 1325 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.189e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.199e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.249e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PCNT-208ENST00000490468 1415 ntTSL 513.35□□□□□ -0.274e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 POM121C-207ENST00000614583 4073 ntTSL 213.34□□□□□ -0.279e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.289e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TSPEAR-AS2-203ENST00000465978 345 ntTSL 513.21□□□□□ -0.299e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.39e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.329e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF2AK4-210ENST00000560855 4789 ntTSL 512.68□□□□□ -0.384e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.389e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.439e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.469e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ZNF830-202ENST00000578339 667 ntTSL 312.15□□□□□ -0.469e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RAC2-207ENST00000481215 480 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.479e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.489e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.499e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-208ENST00000430081 848 ntTSL 511.55□□□□□ -0.569e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.619e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCF2-204ENST00000468073 1031 ntTSL 210.57□□□□□ -0.729e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.759e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.779e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SSFA2-208ENST00000454579 3772 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-201ENST00000263036 2464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.779e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-206ENST00000378764 2498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.789e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SSFA2-215ENST00000495248 219 ntTSL 510.11□□□□□ -0.794e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OAT-206ENST00000490096 579 ntTSL 510.09□□□□□ -0.799e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PRPF4B-209ENST00000494674 1727 ntTSL 510.02□□□□□ -0.89e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 KDM5C-210ENST00000467093 446 ntTSL 39.92□□□□□ -0.829e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TGS1-203ENST00000523948 3159 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.929e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.939e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.939e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EAPP-201ENST00000250454 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.959e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-212ENST00000543015 500 ntTSL 29.11□□□□□ -0.959e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.969e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.019e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-213ENST00000543050 807 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.029e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RAC2-205ENST00000441619 705 ntTSL 58.59□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.059e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 GARS-207ENST00000484093 644 ntTSL 48.47□□□□□ -1.054e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.079e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.139e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PRPF4B-208ENST00000490653 581 ntTSL 27.82□□□□□ -1.169e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.179e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 57.66□□□□□ -1.189e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.199e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.199e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.29e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-218ENST00000475653 909 ntTSL 27.41□□□□□ -1.224e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.259e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.269e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-224ENST00000495049 576 ntTSL 27.15□□□□□ -1.264e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SSFA2-206ENST00000440623 5420 ntTSL 27.1□□□□□ -1.274e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.289e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-202ENST00000438939 330 ntTSL 37.06□□□□□ -1.289e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 26.82□□□□□ -1.324e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-206ENST00000537644 606 ntTSL 36.81□□□□□ -1.329e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.339e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.349e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.379e-6■■□□□ 13.5
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