Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.7 ms