Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P61574 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P61574 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms