Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 59.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.166e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.886e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.386e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.286e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.146e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.046e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.976e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.976e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.376e-11■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-220ENST00000598108 1118 ntTSL 325.06■■□□□ 1.64e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.464e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.394e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.374e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.344e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.064e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-209ENST00000595034 739 ntTSL 320.67■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-205ENST00000593337 633 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-216ENST00000597180 301 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-230ENST00000601809 768 ntTSL 219.3■□□□□ 0.684e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-208ENST00000594387 800 ntTSL 319.11■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-219ENST00000597636 2874 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-226ENST00000600453 700 ntTSL 317.34■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-212ENST00000596756 931 ntTSL 515.4■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-229ENST00000601373 680 ntTSL 214.52□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 IRF3-206ENST00000593818 924 ntTSL 214.26□□□□□ -0.134e-10■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 D2HGDH-208ENST00000445308 955 ntTSL 221.46■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.64e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.181e-17■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 226.65■■□□□ 1.869e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 320.24■□□□□ 0.839e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-211ENST00000524805 982 ntTSL 519.08■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 516.46■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 STK25-223ENST00000470438 515 ntTSL 520.84■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 STK25-228ENST00000487962 2024 ntTSL 219.43■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 STK25-222ENST00000465009 871 ntTSL 219.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 STK25-225ENST00000478403 1123 ntTSL 517.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.786e-8■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-214ENST00000508183 1410 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.845e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 218.48■□□□□ 0.555e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.355e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 517.12■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-223ENST00000513495 600 ntTSL 416.66■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-204ENST00000502350 2258 ntTSL 216.2■□□□□ 0.185e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-212ENST00000507801 538 ntTSL 416.02■□□□□ 0.165e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 215.97■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 521.38■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 18e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 220.1■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.92□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 58.37□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.388e-7■■■■■ 32.7
GTF2F1P35269 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.82□□□□□ -1.482e-59■■■■■ 32.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 84.4 ms