Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNKO75909 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNKO75909 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNKO75909 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNKO75909 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNKO75909 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms