Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms