Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6CA6NDK9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6CA6NDK9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms