Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms