Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRID1Q9ULK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms