Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK-18Q9QC07 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-18Q9QC07 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms