Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 288.3
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 288.3
UTP3Q9NQZ2 AARS2-201ENST00000244571 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 288.3
UTP3Q9NQZ2 DDX41-207ENST00000507900 1564 ntTSL 517.83■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 288
UTP3Q9NQZ2 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.487e-17■■■■■ 288
UTP3Q9NQZ2 THOC5-214ENST00000484924 909 ntTSL 57.91□□□□□ -1.147e-17■■■■■ 288
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-285ENST00000627152 846 ntTSL 513.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 512.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-336ENST00000631189 1156 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-312ENST00000628823 616 ntTSL 512.18□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 511.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-235ENST00000598992 1005 ntTSL 511.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-331ENST00000630863 954 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-335ENST00000631105 702 ntTSL 511.06□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-225ENST00000594715 729 ntTSL 510.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-216ENST00000451228 604 ntTSL 310.34□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 59.91□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-259ENST00000625776 911 ntTSL 59.81□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-274ENST00000626617 1014 ntTSL 59.6□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-327ENST00000630417 918 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-293ENST00000627562 1184 ntTSL 59.06□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-324ENST00000630243 955 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-304ENST00000628301 772 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-208ENST00000431767 486 ntTSL 58.36□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-288ENST00000627363 731 ntTSL 58.18□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-215ENST00000451216 405 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-317ENST00000629686 669 ntTSL 57.64□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 287.9
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 287.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 287.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 287.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-225ENST00000568975 2996 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 287.7
UTP3Q9NQZ2 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 287.5
UTP3Q9NQZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.534e-7■■■■■ 287.4
UTP3Q9NQZ2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 287.4
UTP3Q9NQZ2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 287.4
UTP3Q9NQZ2 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 218.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 287.4
UTP3Q9NQZ2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 287.3
UTP3Q9NQZ2 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 287.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.73e-7■■■■■ 286.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 286.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 286.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 286.8
UTP3Q9NQZ2 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 286.7
UTP3Q9NQZ2 CMTR1-203ENST00000457419 769 ntTSL 315.59■□□□□ 0.095e-10■■■■■ 286.5
UTP3Q9NQZ2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 286.4
UTP3Q9NQZ2 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 311.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 286.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-214ENST00000560402 590 ntTSL 414.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 286
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UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.432e-6■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-218ENST00000587514 540 ntTSL 523.34■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 418.23■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-211ENST00000568731 484 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-11■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.899e-34■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.489e-34■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 285.7
UTP3Q9NQZ2 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 329.94■■■□□ 2.383e-6■■■■■ 284.9
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.297e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.737e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-216ENST00000635383 1647 ntTSL 58.54□□□□□ -1.047e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 LNX1-206ENST00000510143 731 ntTSL 210.02□□□□□ -0.813e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 LNX1-209ENST00000513421 1024 ntTSL 59.5□□□□□ -0.893e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 LNX1-204ENST00000504605 570 ntTSL 48.49□□□□□ -1.053e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 LNX1-205ENST00000507168 572 ntTSL 47.86□□□□□ -1.153e-11■■■■■ 284.3
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.229e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.239e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.249e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.269e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.519e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.569e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-205ENST00000392871 2352 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-218ENST00000491448 2456 ntTSL 55.12□□□□□ -1.599e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-208ENST00000415569 2780 ntTSL 54.76□□□□□ -1.659e-11■■■■■ 284.2
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 421.51■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 284.1
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 284.1
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 283.7
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 283.5
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 283.5
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 521.39■■□□□ 1.017e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 283.1
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