Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIPK3Q9H422 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK3Q9H422 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK3Q9H422 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms