Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPGQ9BPX3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms