Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf20Q8ND61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C3orf20Q8ND61 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf20Q8ND61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf20Q8ND61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms