Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF493Q6ZR52 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF493Q6ZR52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms