Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H1Q32P28 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H1Q32P28 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms