Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFTN1Q14699 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN1Q14699 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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