Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX1P40424 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX1P40424 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX1P40424 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX1P40424 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX1P40424 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX1P40424 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX1P40424 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX1P40424 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX1P40424 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX1P40424 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX1P40424 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX1P40424 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX1P40424 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms