Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK1P35558 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK1P35558 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK1P35558 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK1P35558 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCK1P35558 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCK1P35558 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCK1P35558 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCK1P35558 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK1P35558 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK1P35558 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK1P35558 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms