Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRIP30626 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRIP30626 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRIP30626 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRIP30626 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRIP30626 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRIP30626 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms